Rafaël Amersfoort is een grote gemeente. Omdat we onderlinge relaties erg belangrijk vinden, bestaat de gemeente om die reden uit een netwerk van kleine huisgroepen. Dit zijn kleine groepen mensen (met een gemiddeld bezoekersaantal van twaalf) die veelal bij een van de gemeenteleden thuis bij elkaar komen. Het doel van de kleine groepen is dat de leden samen God ontmoeten en dat zij zullen groeien in geloof, liefde en zorg voor elkaar.